V jádru řešení problémů

Jako ředitel BioMicro Centra (BMC) na MIT, Stuart Levine ’97 s nadšením přijímá rozmanitost výzev, kterým čelí každý den. BMC, jedno z více než 50 základních zařízení poskytujících sdílené zdroje v rámci institutu, dodává výzkumníkům na MIT integrovanou genomiku s vysokou propustností, analýzu jednobuněčné a prostorové transkriptomiky, podporu bioinformatiky a správu dat.

„Každý den je jiný,“ říká Levine, „vždycky jsou tu nové problémy, nové výzvy a technologie se neustále vyvíjejí neuvěřitelným tempem.“ Po více než 15 letech v této roli je Levine vděčný, že šíře jeho práce mu umožňuje hledat řešení pro tolik vědeckých problémů.

Kombinace bioinformatických znalostí s biotechnologickými vztahy a zaměřením na maximalizaci dopadu práce centra, Levine přináší širokou škálu dovedností potřebných k řešení rozmanitosti otázek kladených výzkumníky na Biologické fakultě MIT.

Rozsiahle znalosti

Biologie zaujala Levina již během jeho studia na MIT, konkrétně v předmětu 7.012 (Úvod do biologie), díky charismatu profesorů Erica Landera a emeritní profesorky Nancy Hopkinsové. Po získání doktorátu z biochemie na Harvardově univerzitě a Massachusetts General Hospital se Levine vrátil na MIT na postdoktorální práci s profesorem Richardem Youngem, klíčovým členem Whitehead Institute for Biomedical Research.

V Youngově laboratoři Levine objevil své poslání jako informatik a nakonec se rozhodl zůstat na MIT. Jeho práce zde má dalekosáhlý dopad: BMC ročně slouží více než 100 laboratořím, od Laboratoře pro informatiku a umělou inteligenci a kateder mozkových a kognitivních věd, věd o Zemi, atmosféře a planetách, chemického inženýrství, strojírenství a samozřejmě biologie.

„Je to zábavný způsob, jak přemýšlet o vědě,“ říká Levine a poznamenává, že aplikuje své znalosti a zefektivňuje pracovní postupy napříč těmito mnoha obory tím, že „opravdu a hloubkově rozumí složitostem přístrojů.“

Tato hloubka porozumění a zkušeností umožňuje Levinovi vést to, co jeho dlouholetá kolegyně profesorka Laurie Boyerová popisuje jako „špičkové základní zařízení, které sloužilo tolika fakultám a poskytuje klíčové školicí příležitosti pro všechny.“ On a jeho tým pracují s špičkovými, precizně naladěnými vědeckými přístroji, které generují obrovské množství bioinformatických dat, a poté používají výkonné výpočetní nástroje k ukládání, organizaci a vizualizaci shromážděných dat, čímž přispívají k výzkumu témat od interakcí hostitel-parazit až po navrhované nástroje pro politiku ochrany planet NASA.

Udržování si náskoku

S vědcem, který řídí základní zařízení, si BMC klade za cíl umožnit výzkumníkům „využít co nejlépe metody systémové biologie,“ říká Levine. Tyto metody využívají pokročilé výzkumné technologie k provádění úkonů, jako je příprava velkých sad DNA a RNA pro sekvenování, čtení sekvencí DNA a RNA z jednotlivých buněk a lokalizace exprese genů do specifických tkání.

Levine prezentuje lehký, průhledný obdélník o šířce mobilního telefonu a délce VHS kazety.

„Toto je průtoková cela, která dokáže za dva dny provést 20 lidských genomů s klinickým významem – 8 miliard přečtení,“ říká. „K dispozici jsou i novější přístroje s několikanásobně větší kapacitou.“

Většina výzkumných laboratoří takovouto kapacitu nepotřebuje, ale institut a jeho výzkumníci jako celek ano. Levine zdůrazňuje, že „návratnost investic (ROI) do podpory sdílených zdrojů je extrémně vysoká, protože jakákoli podpora, kterou obdržíme, neovlivňuje pouze jednu laboratoř, ale všechny laboratoře, které podporujeme. Udržování sdílených zdrojů MIT na špici vědy je klíčové pro naši schopnost měnit svět.“

Aby si udržel náskok ve výzkumných technologiích, Levine udržuje vztahy se společnostmi, zatímco jeho vědecké porozumění mu umožňuje vzdělávat výzkumníky o tom, co je možné v oblasti moderní systémové biologie. Celkově mu tyto vlastnosti umožňují pomoci jeho klientům-výzkumníkům „posouvat hranice dosažitelného.“

Muž za stroji

Každé základní zařízení funguje jako malý podnik, který nabízí specializované služby rozmanité klientele napříč akademickým a průmyslovým výzkumem, podle Amy Keatingové, Jay A. Stein (1968) profesorky biologie a vedoucí Katedry biologie. Vysvětluje, že „doktorandské vzdělání a vědecké a technologické znalosti ředitelů základních zařízení MIT jsou klíčové pro úspěch výzkumu v oblasti životních věd na MIT i mimo něj.“

Zatímco Levine má jasně vzdělání a znalosti, úspěch „podniku“ BMC je také částečně způsoben jeho houževnatostí a zaměřením na výsledky pro uživatele základního zařízení.

V roce 2015 byl institutem oceněn cenou MIT Infinite Mile Award a v roce 2017 cenou MIT Excellence Award, za kterou jeden z nominátorů napsal: „To, co činí Stuartův vedoucí post v BMC skutečně cenným pro komunitu MIT, je jeho neochvějná oddanost produkci vysoce kvalitních dat a jeho vytrvalá vytrvalost v řešení jakéhokoli typu odstraňování problémů potřebných pro projekt. Tyto vlastnosti, které Stuart pěstuje, prostupují celou kulturou BMC.“

„Prioritou pro něj jsou výzkumníci a jejich výzkum, ať už poskytuje vzdělání, technické služby, obecnou technickou podporu nebo networking s externími spolupracovníky mimo MIT,“ říká Noelani Kamelamela, manažerka laboratoře BMC. „Vše je ve službě uživatelům a jejich projektům.“

Levineho kancelář, zasunutá do vzdáleného rohu laboratoře BMC, je vhodným symbolem jeho pokory. Zatímco jeho vedení a znalosti jsou středem toho, co povyšuje BMC nad technickou podporu, on sám sedí mimo reflektory a rozhodně podporuje ostatní v posouvání vědy vpřed.

„Stuart byl vždycky člověkem, často v zákulisí, který posouvá skvělou vědu, nápady a lidi vpřed,“ říká Boyerová. „Jeho znalosti a rady nám skutečně umožnily být v naší práci na špici.“